En orthopédie (étude des os et des articulations) et en traumatologie, le scanner permet d’avoir des images en coupe mince des os, muscles, tendons et de multiples organes dans le même examen. Cela lui donne une place privilégiée dans le bilan des lésions, que ce soit dans le domaine de la rhumatologie ou dans la traumatologie plus lourde, pour le bilan en urgence des accidentés dont on craint des blessures multiples.

Les pathologies bucco-dentaires des rongeurs et des lapins sont parmi les plus fréquentes et nécessitent toute l’attention des propriétaires. Le scanner, comparé à des radiographies classiques, a l’avantage de mieux pouvoir localiser les anomalies et de voir plus précisément les répercussions sur les tissus environnants. Il s’agit notamment de l’examen de choix avant intervention chirurgicale lors d’abcès dentaire.

Les corps étrangers, qu’ils soient digestifs, respiratoires ou urinaires  représentent un véritable danger. Ils sont difficiles à localiser par échographie ou radiographie, et seule l’imagerie en coupes fines permet de savoir exactement où ils se trouvent. Le chirurgien peut alors intervenir de façon précise et moins invasive.

Dans les pathologies de l’appareil respiratoire supérieur, qui se traduisent par un écoulement nasal chronique, une respiration difficile ou des saignements, le scanner permet souvent d’identifier la cause (tumeur, corps étranger, fistule) là où les méthodes classiques d’imagerie sont insuffisantes.

Les pathologies de l’oreille du chien sont très fréquentes du fait de la morphologie de celle-ci. Les affections de la bulle tympanique, « caisse de résonance » du système auditif, mais aussi   centre de l’équilibre se traduisent par des pertes d’équilibre, une tête penchée sur le côté, des vomissement chroniques : c’est ce qu’on appelle le syndrome vestibulaire.

Le scanner permet d’identifier la cause de ce syndrome : tumeur, infection, corps étranger.

Anomalie vasculaire congénitale, bilan d’extension, corps étranger, le thorax est le siège fréquent d’affections que seul le scanner permet de diagnostiquer.